うっかりスキップして大損するところだったので書いておきます。
メインメニューの確定申告をクリック。ずーっと進めていく。
「4-1. 所得控除の選択」まで進んだところで「社会保険料控除を受けますか？」の「はい」にチェック。次へ進む。
「源泉徴収票に記載された社会保険等の金額以外に申告する社会保険料はありますか？」で「はい」を選択します。
国民年金保険料と国民健康保険の二つを控除したいので、「～社会保険料を何か所に支払っていますか？」で「２か所」を選びます。
「社会保険の種類」のドロップダウンから「国民年金」と「国民健康保険」を選んで金額を入力します。